脳卒中・心臓病等総合支援センター事業は脳卒中・心臓病等（循環器病）患者を中心とした包括的な支援体制を構築するために、多職種が連携して総合的な取組をすすめる事業であり、これまで各都道府県が医療計画などで実施している対策よりも幅広い内容です。
脳卒中・心臓病等の支援に関して、それぞれの医療施設で個々の取組はされているものの情報が行き渡っているとはいえず、全ての支援について、十分なレベルで提供することに対して課題がありました。そこで支援の取組を効果的に推進するため、専門的な知識を有し、地域への情報提供等の中心的な役割を担う医療機関に脳卒中・心臓病等総合支援センターが設置されることになりました。
都道府県と連携しつつ、地域の医療機関と協力体制を強化し、包括的な支援体制を構築することにより、地域全体の患者支援体制の充実を図ることを目的としています。